Протизапальний ефект від Алфлутопа стає помітним через 7-8 днів після початку терапії. Для отримання стійкого ефекту колоти препарат слід протягом тривалого часу (до півроку). Повторний курс лікування можливий не раніше, ніж через 4-6 місяців після завершення попереднього.
Алфлутоп запобігає руйнуванню макромолекулярних структур нормальних тканин, стимулює процеси відновлення в інтерстиціальній тканині та тканині суглобового хряща, що пояснює його знеболювальну дію.
Курс лікування становить 20 ін'єкцій (по 1 ін'єкції на день протягом 20 днів). При переважному ураженні великих суглобів препарат вводять внутрішньосуглобово по 1 – 2 мл у кожний суглоб з інтервалом 3-4 дні.