У новонароджених, інфікованих ЦМВ під час або після народження, особливо у недоношених дітей, може розвинутися сепсисоподібний синдром, пневмонія, гепатоспленомегалія, гепатит (що може спричинити печінкову недостатність), тромбоцитопенію та атиповий лімфоцитоз.
В даний час єдиним дієвим методом терапії та невідкладної профілактики ЦМВІ у новонароджених є використання імуноглобуліну для внутрішньовенних вливань, що містить антитіла класу IgG до ЦМВ.
У 70-80% випадків уродженої ЦМВІ діти мають більше одного з трьох симптомів: низька маса тіла при народженні, жовтяниця, тромбоцитопенія [5-7, 15]. Тільки для антенатального зараження ЦМВ характерно ураження центральної нервової системи.
Первинне інфікування матері під час вагітності пов'язане з великим ризиком для плода (30-50%). В результаті 10-15% дітей можуть мати порушення слуху або зору, судоми, уповільнення внутрішньоутробного розвитку, мікроцефалію (зменшення розміру мозку).